Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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PTPRNQ16849 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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PTPRNQ16849 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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PTPRNQ16849 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRNQ16849 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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