Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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LAMA3Q16787 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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LAMA3Q16787 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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