Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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