Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FXNQ16595 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FXNQ16595 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms