Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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GRIK5Q16478 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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