Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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