Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.6 ms