Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITSN1Q15811 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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