Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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