Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms