Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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BRD3Q15059 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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BRD3Q15059 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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