Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3AQ14563 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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