Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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SCARF1Q14162 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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SCARF1Q14162 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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SCARF1Q14162 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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SCARF1Q14162 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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SCARF1Q14162 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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SCARF1Q14162 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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SCARF1Q14162 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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SCARF1Q14162 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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SCARF1Q14162 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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SCARF1Q14162 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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SCARF1Q14162 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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SCARF1Q14162 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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SCARF1Q14162 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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