Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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