Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.4 ms