Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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