Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SP140Q13342 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SP140Q13342 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SP140Q13342 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SP140Q13342 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SP140Q13342 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SP140Q13342 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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