Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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