Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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CLN3Q13286 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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CLN3Q13286 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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CLN3Q13286 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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