Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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