Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COX10Q12887 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COX10Q12887 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COX10Q12887 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
COX10Q12887 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COX10Q12887 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COX10Q12887 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
COX10Q12887 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COX10Q12887 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
COX10Q12887 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
COX10Q12887 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
COX10Q12887 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
COX10Q12887 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
COX10Q12887 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
COX10Q12887 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
COX10Q12887 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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