Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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