Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ERVV-1B6SEH8 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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