Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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