Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PSDA5PKW4 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms