Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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SNX13Q9Y5W8 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SNX13Q9Y5W8 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SNX13Q9Y5W8 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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SNX13Q9Y5W8 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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SNX13Q9Y5W8 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SNX13Q9Y5W8 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SNX13Q9Y5W8 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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SNX13Q9Y5W8 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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SNX13Q9Y5W8 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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SNX13Q9Y5W8 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SNX13Q9Y5W8 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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SNX13Q9Y5W8 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNX13Q9Y5W8 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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