Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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COPS7AQ9UBW8 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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COPS7AQ9UBW8 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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COPS7AQ9UBW8 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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