Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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