Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms