Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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