Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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CCDC142Q17RM4 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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CCDC142Q17RM4 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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CCDC142Q17RM4 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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