Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.3 ms