Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms