Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms