Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.59□□□□□ -2
USF2Q15853 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
USF2Q15853 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USF2Q15853 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USF2Q15853 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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