Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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SS18Q15532 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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