Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SHHQ15465 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SHHQ15465 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SHHQ15465 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SHHQ15465 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SHHQ15465 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SHHQ15465 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHHQ15465 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SHHQ15465 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHHQ15465 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHHQ15465 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHHQ15465 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SHHQ15465 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHHQ15465 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHHQ15465 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SHHQ15465 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHHQ15465 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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