Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
EEA1Q15075 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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EEA1Q15075 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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EEA1Q15075 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
EEA1Q15075 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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