Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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COL19A1Q14993 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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COL19A1Q14993 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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COL19A1Q14993 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL19A1Q14993 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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