Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DSC3Q14574 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
DSC3Q14574 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DSC3Q14574 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
DSC3Q14574 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms