Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.4 ms