Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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COL4A6Q14031 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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COL4A6Q14031 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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COL4A6Q14031 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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COL4A6Q14031 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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COL4A6Q14031 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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COL4A6Q14031 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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COL4A6Q14031 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
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COL4A6Q14031 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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COL4A6Q14031 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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COL4A6Q14031 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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COL4A6Q14031 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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