Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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PDE6HQ13956 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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PDE6HQ13956 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
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PDE6HQ13956 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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PDE6HQ13956 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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PDE6HQ13956 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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PDE6HQ13956 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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