Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCINQ13939 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms