Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CUL4AQ13619 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.4 ms