Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms