Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.13
ATRQ13535 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.13
ATRQ13535 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
ATRQ13535 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATRQ13535 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATRQ13535 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATRQ13535 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATRQ13535 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATRQ13535 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATRQ13535 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATRQ13535 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATRQ13535 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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