Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PICALMQ13492 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms