Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.1 ms