Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms